Juhtimine
EELK juhtimisorganid on kirikukogu, konsistoorium, piiskoplik nõukogu, piiskoppide kogu ja vaimulike konverents.
Kirikukogu
Kirikukogu on EELK kõrgeim seadusandlik ja korraldav organ. Ameti poolest kuuluvad sinna peapiiskop, piiskopid, kantsler, assessorid ja praostkondade praostid. Valitavad liikmed on iga praostkonna sinodi valitud kolm esindajat, vaimulike konverentsi kaks esindajat ning peapiiskopi nimetatud kaks kaplanaatide esindajat. Ametis on XXXII kirikukogu alates 25. novembrist 2025.

Konsistoorium
Konsistoorium on EELK valitsus. Ameti poolest kuuluvad sinna ametis olev peapiiskop ja piiskopid; peapiiskop on konsistooriumi president. Valitavad liikmed on kantsler ja kaks kuni neli assessorit, kelle valib kirikukogu neljaks aastaks.
- Peapiiskop Urmas Viilma
- Piiskop Ove Sander
- Piiskop Marko Tiitus
- Piiskop Anti Toplaan
- Kantsler Andrus Mõttus
- Assessor Mattias Haamer
- Assessor Katrin-Helena Melder
- Assessor Toomas Nigola
Piiskoplik nõukogu
Piiskoplik nõukogu on peapiiskopile abiks kiriku juhtimisel ja õpetuslike seisukohtade kujundamisel. Selle pädevuses on õpetusse ja liturgiasse puutuvad otsused ning usu ja kõlbluse alal tekkivate üldiste küsimuste lahendamine.
Piiskoppide kogu
Piiskoppide kogu liikmed on peapiiskop ja piiskopid. Selle pädevuses on vaimuliku ameti pidamist puudutavate üksikküsimuste ning usu ja kõlbluse alal tekkivate üksikute vaidlusküsimuste lahendamine.
Vaimulike konverents
Vaimulike konverentsi liikmed on EELK vaimulikud. Konverents kiidab heaks õpetuse aluste muutmise, liturgia käsiraamatu ja õpetusliku sisuga oikumeenilised kokkulepped enne küsimuse otsustamist piiskoplikus nõukogus või kirikukogus, valib kaks kirikukogu liiget ning arutab muid kirikuelu küsimusi.